El Gobierno Regional esta conformado por el Intendente, quien constituye el Organo Ejecutivo del Gobierno Regional - y en esa condición es el Jefe Superior de sus servicios administrativos - y el Consejo Regional, que es un órgano colegiado con carácter resolutivo.
La estructura administrativa se compone de dos divisiones: División de Administración y Finanzas, División de Análisis y Control de Gestión y la funcion de Planificación y Desarrollo Regional, complementándose con la existencia de dos departamentos - Departamento Jurídico y Departamento de Auditoria Interna - que dependen directamente del Intendente.